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分子生物學試劑
qPCR相關(guan)
R02122x示蹤型定量試劑盒
品牌 | LABLEAD | 貨號 | R0212 |
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供貨周期 | 一周 |
2x示蹤型定量試劑盒
貨號:R0212
儲(chu) 存條件:長期保存請於(yu) -20℃避光保存,解凍後可在 4℃避光條件下穩定存放一個(ge) 月,盡量避免反複凍融。
產(chan) 品組分:
組分 | 貨號 | 500T | 1000T | 2500T |
2x Visual SYBR qPCR mixture Universal | R0212-A | 4*1.25ml | 8*1.25ml | 20*1.25ml |
10× Dilution Buffer | R0212-B | 1ml | 2*1ml | 5*1ml |
產(chan) 品描述
2x Visual Realab Green PCR Fast mixture通用型(示蹤型定量試劑盒)是SYBR Green l嵌合染料法專(zhuan) 用 qPCR 試劑,為(wei) 2x預混液,包含除引物和 DNA 樣品以外的所有 qPCR 組分,可減少操作步驟,縮短加樣時間,降低汙染幾率。其核心組分是經抗體(ti) 修飾的熱啟動 Tag DNA 聚合酶,配合精心優(you) 化的 Buffer 體(ti) 係以及 PCR 反應促進因子,特異性強、擴增效率高,可有效抑製非特異性擴增,對寬廣濃度範圍的模板進行準確定量,獲得穩定可靠的 qPCR結果。本品已含有通用校正染料,與(yu) 絕大多數 qPCR 設備兼容,不需要額外添加染料來校正儀(yi) 器。
本品可利用不同染料混合後產(chan) 生的變色效應,追蹤移液過程,從(cong) 而顯著減少移液錯誤。2x Visual Realab Green PCR Fast mixture通用型中包含藍色染料,10x Dilution Buffer 中包含黃色染料。當 2x Visual Realab Green PCR Fast mixture通用型(藍色)中加入了用 Dilution Buffer稀釋的模板(黃色)後會(hui) 產(chan) 生藍色→綠色的變色效應,從(cong) 而可以根據液體(ti) 顏色準確判斷是否已加入模板。
使用方法:
1. 模板稀釋
使用過程中,如需要進行移液追蹤,則根據下表選擇合適的方式提前添加 Dilution Buffer 至模板中,然後進行 qPCR 檢測;如不需要進行移液追蹤,則不使用 Dilution Buffer 即可。
DNA 模板狀態 | 10× Dilution Buffer 使用方式 | 模版中Dilution Buffer 濃度 |
固體(ti) | 使用 ddH,0 將 10x Dilution Buffer 稀釋至 1x,使用 1xDilution Buffer溶解 DNA | 1x |
液體(ti) | 如有必要,先使用 ddH20 將模板稀釋至目標濃度,然後在每 9μl模板中加入 1ul 10x Dilution Buffer | 1x |
建議的 qPCR 反應體(ti) 係
試劑 | 使用量 | 終濃度 |
2x Visual SYBR qPCR mixture Universal | 10ul | 1 x |
正向引物(10uM)a | 0.4ul | |
反向引物(10uM)a | 0.4ul | |
DNA模版b | X ul | |
Nuclease-Free Water | To 20ul |
a. 通常推薦的引物終濃度為(wei) 0.2 μM,可在 0.1~1 μM 範圍內(nei) 調整;
b. 如使用 Dilution Buffer 進行加樣追蹤,模板體(ti) 積請勿超出2~5μl/20 μl reaction。
如果模板用量低於(yu) 2 μl/20 μl reaction,會(hui) 造成顯色偏淡,影響追蹤效果;如果模板用量高於(yu) 5 μl/20 μl reaction,Dilution Buffer 中的成分可能會(hui) 幹擾 qPCR 反應。不同種類 DNA 模板中含有的靶基因拷貝數目不同,必要時可進行梯度稀釋,以確定最佳的 DNA 模板添加量。
注:當模板類型為(wei) 未稀釋 cDNA 原液時,不論其是否包含 1× Dilution Buffer,使用體(ti) 積均不應超過 qPCR 反應總體(ti) 積的 1/10,即 2 μl/20 μl reaction。
3. qPCR 反應程序(可根據機型適當調整)
兩(liang) 步法
步驟 | 溫度 | 時間 | 循環 |
預變性 | 95℃ | 30s | |
變性 | 95℃ | 10s | 40cycles |
退火 & 延伸a | 60℃ | 30s | |
溶解曲線 | 使用儀(yi) 器默認采集程序 |
三步法
步驟 | 溫度 | 時間 | 循環 |
預變性 | 95℃ | 30s | |
變性 | 95℃ | 10s | 40 cycles |
退火a | 55~65℃ | 10s | |
延伸a | 72℃ | 30s | |
溶解曲線 | 使用儀(yi) 器默認采集程序 |
a.根據引物的 Tm 值進行退火&延伸(退火)溫度的設定;若擴增片段在 200bp 以內(nei) ,退火 &延伸(延伸)時間可以設置為(wei) 15 s;此外,退火&延伸(延伸)時間的設置還需根據您使用的 qPCR 儀(yi) 所需要的最短數據采集時間自行調整。
4.實驗優(you) 化
① 引物濃度調整
當引物終濃度在 0.1~1.0 μM 範圍之間變化時,引物濃度越低,擴增特異性越高,但擴增效率會(hui) 有所下降。
② 擴增程序優(you) 化
需提高擴增特異性,可使用兩(liang) 步法程序或提高退火溫度;需提高擴增效率,可使用三步法程序或延長延伸時間。
5.引物設計原則
① 擴增產(chan) 物長度建議控製在 80~200 bp;
② 引物長度為(wei) 18~25 bp;
③ 兩(liang) 條 Tm 值相差不超過 1℃,Tm 值控製在 58~62℃;
④ 引物的 GC 含量控製在 40%~60%;
⑤ 引物 A、G、C、T 整體(ti) 分布盡量要均勻,避開 T/C 或者 A/G 的連續結構(特別是 3' 端),3' 端最後一個(ge) 堿基最好為(wei) G 或者 C;
⑥ 避開引物內(nei) 部或者兩(liang) 條引物之間的互補序列;
⑦ 使用 NCBI BLAST功能檢索確認引物的特異性。