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分子生物學試劑
qPCR相關(guan)
R02022x Realab Green PCR Fast mixture通用型
品牌 | 其他品牌 | 貨號 | R0202 |
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規格 | 100T,500T,1000T | 供貨周期 | 現貨 |
Taq SYBR® Green qPCR Premix (通用型)
產(chan) 品貨號:R0202
儲(chu) 存條件:長期保存請於(yu) -20℃避光保存,Mix 融解後可在 4℃避光條件下穩定存放一個(ge) 月,盡量避免反複凍融。
2x Realab Green PCR Fast mixture通用型產(chan) 品簡介
Taq SYBR® Green qPCR Premix 是 SYBR® Green I 嵌合染料法專(zhuan) 用qPCR試劑,為(wei) 2×預混液,包含除引物和DNA樣品以外的所有qPCR組分,可減少操作步驟,縮短加樣時間,降低汙染幾率。其核心組分是經抗體(ti) 修飾的熱啟動Taq DNA聚合酶,配合精心優(you) 化的Buffer體(ti) 係以及PCR反應促進因子,使產(chan) 品具有特異性強、擴增效率高等特點,有效抑製非特異性擴增,可對寬廣濃度範圍的模板進行準確定量,獲得穩定可靠的qPCR結果。
2x Realab Green PCR Fast mixture通用型使用方法:
1.適配機型
全機型通用
2.使用注意
① 因Mix中預混有染料,其保存或反應體(ti) 係配製過程應避免強光照射;
② 使用前上下顛倒輕輕混勻Mix,請勿渦旋振蕩混勻,避免產(chan) 生過多氣泡。
3.建議的qPCR反應體(ti) 係
試劑 | 使用量 | 終濃度 |
Taq SYBR® Green qPCR Premix | 10ul | 1× |
正向引物 (10uM)a | 0.4ul | 0.2uM |
反向引物(10uM)a | 0.4ul | 0.2uM |
DNA模板b | X ul | 10~200 ng/20ul |
Nuclease-Free Water | To 20ul |
a.調通推薦的引物終濃度為(wei) 0.2uM,反應效果不佳時可在0.1~1uM範圍內(nei) 進行調整;
b.推過薦模板加樣量的為(wei) 1~2ul,如模板類型為(wei) 未稀釋cDNA原液,模板添加量不應超過總反應體(ti) 係的10%,不同種類DNA模板中含有的靶基因拷貝數目不同,必要時可進行梯度稀釋,以確定必要的DNA模板添加量。
4.qPCR 反應程序(可根據機型適當調整)
兩(liang) 步法:
三步法:
a.根據引物的Tm值進行退火&延伸(退火)溫度的設定;若擴增片段在200bp以內(nei) ,退火&延伸(延伸)時間可以設置為(wei) 15sec;此外,退火&延伸(延伸)時間的設置還需根據您使用的qPCR儀(yi) 所需的最短數據采集時間自行調整;
b.不同 qPCR 儀(yi) 的熔解曲線采集程序有差別,一般可使用儀(yi) 器默認的熔解曲線采集程序。
5.實驗優(you) 化
若使用默認反應條件反應性能不佳時,則需要進行反應條件的優(you) 化,可以從(cong) 引物濃度以及擴增程序兩(liang) 個(ge) 方麵進行:
① 引物濃度調整
當引物終濃度在0.1~1.0uM範圍之間變化時,引物濃度越低,擴增特異性越高,但擴增效率會(hui) 有所下降。
② 擴增程序優(you) 化
需提高擴增特異性,可使用兩(liang) 步法程序或提高退火溫度;需提高擴增效率,可使用三步法程序或延長延伸時間。
6.引物設計原則
① 擴增產(chan) 物長度建議控製在80~200bp;
② 引物長度為(wei) 18~25bp;
③ 正向引物和反向引物的Tm值相差不超過 1℃為(wei) 佳,Tm值控製在58~62℃為(wei) 佳;
④ 引物的GC含量控製在 40%~60% 之間;
⑤ 引物A、G、C、T整體(ti) 分布盡量要均勻,避開T/C或者A/G的連續結構(特別是3'端);
⑥ 引物3'端zuihou一個(ge) 堿基zuihao為(wei) G或者C;
⑦ 避開引物內(nei) 部或者兩(liang) 條引物之間的互補序列;
⑧ 使用NCBI BLAST功能檢索確認引物的特異性。
問題描述 | 可能原因 | 解決(jue) 辦法 |
擴增曲線不光滑 | 熒光信號太弱,經係統校正後產(chan) 生 | 確保Mix中預混的染料未降解;更換熒光信號收集更好的qPCR專(zhuan) 用耗材 |
擴增曲線斷裂或下滑 | 模板濃度較高,基線的終點值大於(yu) Cq 值 | 減小基線終點(Cq-4),重新分析數據 |
個(ge) 別孔擴增曲線突然驟降 | 反應管內(nei) 留有氣泡 | 確保Mix*溶解,請勿渦旋振蕩混勻 加樣完成後輕彈離心去除氣泡 延長預變性時間至10min,以去除氣泡 |
反應結束無擴增曲線出現 | 反應循環數偏少 | 設置循環數為(wei) 40,但更多的循環數會(hui) 增加過多的背景信號 |
熒光信號采集步驟未設置或者設置錯誤 | 兩(liang) 步法擴增程序一般將信號采集設置在退火&延伸階段,三步法擴增程序應當將信號采集設置在72℃延伸階段 | |
引物可能降解 | 長期未用的引物,應先通過PAGE電泳檢測完整性,以排除其降解的可能 | |
模板濃度過低 | 減少模板稀釋倍數重複實驗,樣品濃度未知的情況下先從(cong) higest濃度做起 | |
模板降解 | 重新製備模板,重複實驗 | |
Cq 值出現過晚 | 擴增效率低 | 提高引物濃度,嚐試三步法擴增程序,或者重新設計引物 |
模板濃度過低 | 減少模板稀釋倍數重複實驗,樣品濃度未知的情況下先從(cong) GAO濃度做起 | |
模板降解 | 重新製備模板,重複實驗 | |
擴增產(chan) 物過長 | 擴增產(chan) 物長度控製在80~200 bp | |
體(ti) 係中存在 PCR 抑製劑 | 一般為(wei) 模板帶入,加大模板稀釋倍數或重新製備純度高的模板重複實驗 | |
空白對照出現信號 | 反應體(ti) 係汙染 | 首先更換空白對照的水,如果還發生同樣情況,繼續更換引物、吸頭、PCR 管或啟用新的Mix;反應體(ti) 係在超淨工作台內(nei) 配製,減少氣溶膠汙染 |
出現引物二聚體(ti) 等非特異性擴增 | 一分般析在 35 循環以後空白對照出現擴增產(chan) 物屬正常情況,應配合熔解曲線進行重新設計引物,調整引物濃度或優(you) 化PCR反應程序 | |
熔解曲線出現多峰 | 引物設計不佳 | 根據引物設計原則重新設計新引物 |
引物濃度過高 | 適當降低引物濃度 | |
cDNA 模板存在基因組汙染 | 提取後的RNA溶液使用DNA酶進行消化,例如:dsDNase,以去除基因組汙染,或設計跨內(nei) 含子引物 | |
實驗重複性差 | 加樣誤差大 | 使用精準的移液器、配合高品質吸頭準確移液 高倍稀釋模板,加入大體(ti) 積模板減少加樣誤差 放大qPCR反應體(ti) 積 |
模板濃度過低 | 減少模板稀釋倍數重複實驗 | |
qPCR儀(yi) 不同位置的溫度偏差 | 定期校準qPCR儀(yi) |