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酵母相關(guan)
酵母轉化
L7278-100T/500T酵母菌落PCR試劑盒(堿裂解法)
product
產品分類品牌 | LABLEAD | 貨號 | L7278 |
---|---|---|---|
供貨周期 | 現貨 | 應用領域 | 生物產業 |
酵母菌落PCR試劑盒(堿裂解法)
貨號:L7278
儲(chu) 存條件:
-20ºC保存,至少一年有效。
Yeast Lysis Buffer和Neutralization Buffer可以室溫或4ºC保存,至少一年有效。
Yeast Colony PCR Mix (Red, 2X)盡量避免反複凍融。
產(chan) 品組分:
組分 | 100T | 500T |
A. Yeast Lysis Buffer | 1.1ml | 5.5ml |
B. Neutralization Buffer | 1.1ml | 5.5ml |
C. Yeast Colony PCR Mix (Red, 2x) | 1ml | 1ml*5 |
產(chan) 品描述
蘭(lan) 博利德生產(chan) 的酵母菌落PCR試劑盒(堿裂解法)是一種非常便捷的用於(yu) 釀酒酵母、畢赤酵母等菌株在質粒轉化後陽性克隆菌落的PCR篩選和鑒定的試劑盒。本試劑盒提供了Yeast Lysis Buffer用於(yu) 破壞酵母細胞壁,並提供了Yeast Colony PCR Mix (Red, 2X)用於(yu) 進行PCR擴增。Yeast Colony PCR Mix (Red, 2X)是含有紫紅色和黃色染料(電泳位置分別約2.5kb和10bp)的2倍濃度的PCR預混液,含有2X Taq DNA Polymerase、2X PCR Buffer、2X dNTP和2X Loading Buffer等,用戶隻需加入酵母菌落裂解液、引物和水即可進行PCR擴增,並且擴增完畢後可以直接上樣電泳。同時提供了Yeast Lysis Buffer在PCR反應前對酵母進行有效預處理,可以充分釋放酵母DNA,能確保有效進行酵母菌落PCR,從(cong) 而大大縮短酵母轉化後陽性克隆鑒定的時間,提高實驗效率。
酵母細胞的細胞壁主要成分為(wei) 多糖(85%-90%)和蛋白質(10%-15%),其中多糖是由甘露聚糖、β-葡聚糖和少量的幾丁質等組成,處於(yu) 細胞壁內(nei) 層的β-葡聚糖與(yu) 幾丁質共價(jia) 相連,起到細胞骨架的作用;而外層的甘露聚糖與(yu) 中層蛋白質中的絲(si) *酸或蘇*酸以O-糖苷鍵相連接,形成的甘露糖蛋白覆蓋於(yu) 細胞表麵,給予酵母細胞一定的韌性。酵母細胞壁*特的結構致使其DNA難以被簡單的PCR加熱過程所釋放,導致很多將酵母直接作為(wei) 模板進行PCR檢測的試劑盒成功率都比較低。
本試劑盒使用非常便捷。本試劑盒中提供的Yeast Colony PCR Mix (Red, 2X)已經含有所有的通用組分,用戶隻需自備引物和水即可對酵母菌落進行PCR擴增。它大大簡化了PCR操作,使操作更加快捷,也減少了PCR操作過程中可能導致的汙染;同時Yeast Colony PCR Mix (Red, 2X)中已經包含了上樣緩衝(chong) 液組分,PCR擴增結束後即可直接上樣電泳,無需添加上樣緩衝(chong) 液。
本試劑盒中提供了雙色染料,便於(yu) 電泳時觀察電泳進程。本試劑盒中的Yeast Colony PCR Mix (Red, 2X)加入了紫紅色和黃色的電泳示蹤染料(整體(ti) 呈現紅色),其在濃度為(wei) 1%瓊脂糖膠中的遷移位置分別大約位於(yu) 2.5kb和10bp處。PCR結束後可直接進行電泳檢測,無需再添加上樣緩衝(chong) 液。紫紅色和黃色示蹤染料不會(hui) 影響對相應DNA條帶的觀察和檢測。
使用方法:
1. 酵母菌落的裂解
a. 準備PCR管(例如蘭(lan) 博利德生產(chan) 的PCRG-1G 0.2ml優(you) 級PCR單管 ),每管中加入10μl Yeast Lysis Buffer。
b. 用無菌吸頭挑取0.2-1mm酵母單克隆至含10μl Yeast Lysis Buffer的PCR管中,吹打混勻或Vortex混勻,低速離心數秒使液體(ti) 聚集在管底。同時對於(yu) 該菌落進行標記或同時接種該菌落到液體(ti) 培養(yang) 基或新的平板上。
注:菌體(ti) 過多可能會(hui) 影響Yeast Lysis Buffer對酵母的裂解並影響後續PCR反應,菌體(ti) 量通常不宜超過約2μl。
c. 在PCR儀(yi) 上95ºC加熱5分鍾,以充分釋放酵母的DNA。
d. 加入10μl Neutralization Buffer,混勻,後續即可作為(wei) DNA模板用於(yu) PCR檢測。
2. 酵母菌落PCR反應體(ti) 係的設置:
a. 室溫融解Yeast Colony PCR Mix (Red, 2X),上下顛倒輕輕混勻後低速離心數秒。
b. 參考下表在冰浴上設置PCR反應體(ti) 係:
試劑 | 使用量 | 最終濃度 |
Ultrapure water | 7.4μl | - |
Primer mix (5μM each) | 1.6μl | 0.4μM each |
Yeast Colony PCR Mix (Red, 2X) | 10 μl | 1X |
Total volume | 19 μl | - |
注:通常引物的終濃度為(wei) 0.2μM時可獲得良好的檢測效果,也可以根據情況在0.1-1.0μM範圍內(nei) 調整引物的終濃度。擴增效率不高的情況下,可提高引物的濃度;發生非特異性反應時,可降低引物濃度。超純水可以選購D0055WJ(Lablead DNase/RNase-Free, Sterile Water)。
c. 吸取步驟1d準備好的DNA模板1μl至配製好的19μl PCR反應體(ti) 係中,輕輕吹打混勻或輕微Vortex混勻,室溫低速離心數秒,使液體(ti) 聚集在管底。
d. 如果所使用的PCR儀(yi) 有熱蓋則省略本步驟。如果PCR儀(yi) 沒有熱蓋,則在管內(nei) 滴入一滴石蠟油(M8410 Mineral oil)。
e. 把設置好的PCR反應管置於(yu) PCR儀(yi) 上,開始PCR反應。
3. PCR反應參數的設置可以參考如下示例:
Step1(起始變性): 94ºC 3min;Step2(變性): 94ºC 30sec;Step3(退火): 55ºC 30sec
Step4(延伸): 72ºC 1min/kb;Step5(循環): Go To Step2 for 30 cycles;Step6(最終延伸): 72ºC 10min
Step7(臨(lin) 時保存): 4ºC forever
注1:PCR反應的設置需根據模板、引物、PCR產(chan) 物的長度和GC含量等條件的不同,設定不同的PCR反應條件包括溫度、時間和循環數等。
注2:Step4(延伸)的時間設置需根據PCR產(chan) 物的長度進行設置,通常每kb產(chan) 物的延伸時間為(wei) 1分鍾。例如PCR產(chan) 物的長度為(wei) 1kb,則延伸時間可以設置為(wei) 1分鍾,PCR產(chan) 物的長度為(wei) 2kb,則延伸時間可以設置為(wei) 2分鍾,以此類推。
注3:對於(yu) 初次進行的PCR,為(wei) 盡量確保可以擴增出預期的PCR產(chan) 物,可以把循環數設置為(wei) 35。對於(yu) 需進行半定量或定量的PCR反應循環數一定要進行適當優(you) 化,使PCR反應沒有達到平台期。
4. 結果檢測
PCR結束後直接取5-10μl進行電泳檢測,無需添加上樣緩衝(chong) 液。
注意事項:
①酵母菌落較難裂解,裂解時請注意吹打混勻或Vortex震蕩混勻。
②由於(yu) PCR反應非常靈敏,可使目的基因擴增超過1000萬(wan) 倍,在設置PCR反應時請注意避免微量待擴增DNA的汙染,並盡量考慮設置不加模板的空白對照以確認是否有待擴增DNA的汙染。
③避免反複凍融本產(chan) 品,多次反複凍融可能使產(chan) 品性能下降。
④使用本產(chan) 品前,一定要完*融化,並上下顛倒輕輕混勻後才能使用,並盡量避免產(chan) 生氣泡。
⑤超純水推薦選購D0055WJ(Lablead DNase/RNase-Free, Sterile Water)。
⑥本產(chan) 品僅(jin) 限於(yu) 專(zhuan) 業(ye) 人員的科學研究用,不得用於(yu) 臨(lin) 床診斷或治療,不得用於(yu) 食品或藥品,不得存放於(yu) 普通住宅內(nei) 。
⑦為(wei) 了您的安全和健康,請穿實驗服並戴一次性手套操作。