ratbet雷竞技
Product Center當前位置:首頁
ratbet雷竞技
分子生物學試劑
克隆相關(guan)
D0204PDNA Assembly Mix Plus
品牌 | LABLEAD | 貨號 | D0204P |
---|---|---|---|
供貨周期 | 現貨 |
DNA Assembly Mix PLUS KIT產(chan) 品貨號:D0204P
儲(chu) 存條件:-20℃
產(chan) 品組分:
組分/規格 | 10T | 25T | 50T |
DNA Assembly Mix PLUS | 50μl | 125μl | 250μl |
pUC19 Control Plasmid, Linearized (Ampr, 40 ng/μl) | 5μl | 5μl | 5μl |
500 bp Control Fragment (20 ng/μl) | 5μl | 5μl | 5μl |
DNA Assembly Mix PLUS產(chan) 品簡介:
基於(yu) 重組原理的無縫克隆技術,作為(wei) 新一代的克隆方法,不依賴繁瑣的酶切、連接步驟,也不需要末端補平等操作,依據DNA片段與(yu) 線性化載體(ti) 末端的15~25nt同源序列的重組,可將插入片段克隆至任意線性載體(ti) 的任意位點,載體(ti) 自連背景極低,是一種簡單、快速、高效的DNA定向克隆技術。
DNA Assembly MixPLUS無縫克隆試劑盒最快僅(jin) 需5分鍾即可完成單片段重組,且陽性率高於(yu) 95%。Mix中添加的輔助因子,有效提高克隆陽性率;經優(you) 化的反應體(ti) 係,能夠一定程度上耐受未純化PCR產(chan) 物中含有的雜質。升級版的無縫克隆試劑盒具有更高的陽性率、更好的兼容性。
使用簡單 —— 兼容PCR與(yu) 酶切體(ti) 係,省去繁瑣的純化步驟
超高效率 —— 可以穩定支持5-6片段在同一克隆體(ti) 係
穩定可靠 —— 37℃放置一周或凍融30次,無明顯下降
實驗步驟:
1、實驗流程概要
2、線性化克隆載體(ti) 製備
選擇合適的克隆位點,對載體(ti) 進行線性化,載體(ti) 的線性化可以通過酶切或反向 PCR 擴增完成。
① 酶切製備
推薦使用LabFD™快速內(nei) 切酶進行雙酶切,使載體(ti) 線性化wan 全,以降低轉化背景(假陽性克隆);若使用單酶切進行線性化,可以適當延長酶切時間以減少環狀質粒殘留。
注1:經雙酶切進行線性化的載體(ti) 無需去磷酸化,經單酶切則需要去磷酸化;
注2:酶切完成後,應將快速內(nei) 切酶失活或對目的產(chan) 物純化後再用於(yu) 重組反應。
② 反向 PCR 擴增製備
為(wei) 減少擴增突變的引入,推薦使用高保真PCR Mix進行擴增。推薦使用預線性化質粒作為(wei) 模板,以減少環狀質粒模板殘留對克隆陽性率的影響。
3、插入片段PCR引物設計
PCR引物的5' 端必須包含與(yu) 其相鄰片段(插入片段或載體(ti) )末端同源的15~25 nt(推薦18nt)序列。假如載體(ti) 為(wei) 粘性末端,且3'端突出,則引物設計必須包含突出部分;若5'端突出,則引物設計可以包含突出部分,也可以不包含。
插入片段正向擴增引物:
5'—上遊載體(ti) 末端同源序列+酶切位點(可選)+ 基因特異性正向擴增序列— 3'
插入片段反向擴增引物:
3'—基因特異性反向擴增序列+酶切位點(可選)+下遊載體(ti) 末端同源序列—5'
注1:盡量選擇無重複序列且GC含量均勻的區域進行克隆,當載體(ti) 克隆位點上下遊25 nt區域內(nei) GC含量為(wei) 40%~60%時,重組效率zui高;
注2:本試劑盒所提供的 pUC 19 載體(ti) (Ampr)連接端序列如下:
4、插入片段的 PCR 擴增
推薦使用高保真PCR Mix進行擴增,以減少擴增突變的引入。建議使用純化後的PCR產(chan) 物進行無縫克隆反應,若PCR產(chan) 物經瓊脂糖凝膠電泳鑒定為(wei) 特異性擴增產(chan) 物,可直接使用,但加樣體(ti) 積不應超過總反應體(ti) 積的20%。
5、重組反應
①於(yu) 冰水浴中配置以下反應體(ti) 係:
組分 | 反應體(ti) 係 | 陰性對照 | 陽性對照(如有必要) |
DNA Assembly Mix | 5μl | 5μl | 5μl |
線性化載體(ti) (ng) | 50~200ng | 50~100ng | pUC19 Control Plasmid,Linearized, 1 μl |
插入片段 | 10~200 ng | - | 500 bp Control, Fragment, 1 μl |
ddH2O | To 10 μl |
a.最適載體(ti) 用量(ng)=0.02×載體(ti) 堿基對數,即0.03pmol。
b.插入單片段,最適片段用量(ng)= 0.04×片段堿基對數;
插入多片段,每片段zui適用量(ng)= 0.02×片段堿基對數。
注1:若插入單片段的長度大於(yu) 載體(ti) ,則應互換載體(ti) 與(yu) 插入片段用量;
注2:若插入片段的長度小於(yu) 200 bp,則插入片段應使用5倍載體(ti) 用量;
注3:若按上述公式計算得到的用量超過zui低/zui高值,則建議直接按zui低/最高用量使用;
注4:載體(ti) 片段過長、插入片段過長克隆陽性率均會(hui) 降低。
重組反應體(ti) 係配製完成後,用移液槍輕輕吸打混勻各組分,避免產(chan) 生氣泡,切勿渦旋。
② 將反應體(ti) 係置於(yu) 50℃,反應5~60min。
注1:推薦使用 PCR 儀(yi) 等溫控比較精準的儀(yi) 器進行反應,反應時間不足或太長克隆效率均會(hui) 降低;
注2:插入1-2個(ge) 片段時,推薦反應時間5-15min,插入3-5個(ge) 片段時,推薦反應時間15-30min;
注3:當載體(ti) 骨架在 10 kb 以上或插入片段在4 kb以上時,建議延長反應時間到30-60min
注4:50℃反應完成後,建議進行瞬時離心,將反應液收集至管底。
③ 將反應液離心管置於(yu) 冰上冷卻,之後進行轉化或者儲(chu) 存於(yu) -20℃。
注1:-20℃儲(chu) 存的重組產(chan) 物,建議在1周內(nei) 使用。
6、重組產(chan) 物轉化
取5~10μl反應液,加入到100 μl感受態細胞中緩慢吸打混勻,冰上放置30min。42℃熱激45~60sec,冰浴5 min。加500 μl SOC或LB培養(yang) 基,37℃振蕩培養(yang) 40~60min(200 rpm)。將菌液均勻塗布在含有對應抗生素的平板上,倒置於(yu) 37℃過夜培養(yang) 。
注1:不同感受態細胞最後的克隆陽性率會(hui) 有所差別,推薦使用轉化效率>108 CFU/μg的感受態細胞;
注2:菌落數取決(jue) 於(yu) PCR產(chan) 物與(yu) 線性化載體(ti) 的數量和純度;
注3:陽性對照平板通常生長大量白色單菌落,陰性對照平板隻生長很少的菌落。
7、陽性克隆檢測
挑取單菌落至10 μl ddH2O中混勻,95℃裂解10 min 後,取1 μl裂解液作為(wei) 模板,進行菌落PCR鑒定,或將單菌落接種至抗性培養(yang) 基中培養(yang) 過夜後,提取質粒進行酶切鑒定。
注1:菌落 PCR 時建議至少使用一條通用引物,避免假陽性結果;
注2:必要時可進一步對陽性結果進行測序鑒定。
常見問題:
問題描述 | 原因 | 解決(jue) 方法 |
轉化效率低 | 感受態效率低下 | 使用新製備或妥善保存的感受態細胞。 |
DNA片段比例不佳 | 按照說明書(shu) 推薦的zui適用量和比例配製反應體(ti) 係。載體(ti) 和插入片段的濃度測定: 若線性化載體(ti) 與(yu) 插入片段已經過純化,且經電泳檢測條帶單一或無Smear殘留時,可使用超微量核酸蛋白檢測儀(yi) 等基於(yu) 分光光度法的儀(yi) 器進行濃度測定,但隻有當A260/A280 在1.8~2.0之間時濃度值可信;若線性化載體(ti) 與(yu) 插入片段未經過純化,也可使用瓊脂糖電泳測定樣品濃度。 | |
DNA片段純度不夠 | 對載體(ti) 和插入片段進行膠回收純化。由於(yu) EDTA等金屬離子螯合劑會(hui) 抑製無縫克隆反應,因此純化產(chan) 物應溶解於(yu) ddH2O中,切勿使用Tris-EDTA等緩衝(chong) 液。 | |
反應產(chan) 物過量 | 在轉化體(ti) 係中,無縫克隆反應產(chan) 物體(ti) 積不應超過感受態細胞體(ti) 積的10%。 | |
大量克隆不含插入片段 | 載體(ti) 線性化不wan全 | 酶切製備線性化載體(ti) 時,提高快速內(nei) 切酶的使用量,延長反應時間,使用膠回收純化酶切產(chan) 物。 |
相同抗性質粒汙染 | 以質粒為(wei) 模板進行插入片段 PCR 擴增時,使用預線性化質粒作為(wei) 擴增模板,使用DpnI 等甲基化敏感型內(nei) 切酶對擴增產(chan) 物進行處理,或對產(chan) 物進行膠回收純化。 | |
平板抗性不足 | 確保使用正確的抗生素,並使用新鮮製備的抗生素平板。 | |
大量克隆含有 不正確插入片段 | 非特異性PCR擴增產(chan) 物 | 優(you) PCR體(ti) 係,提高擴增特異性,或膠回收純化PCR產(chan) 物重疊序列的擴增引物。 |