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分子生物學試劑
克隆相關(guan)
LabpO TOPO-TA/Blunt Simple通用克隆試劑盒
品牌 | 其他品牌 | 貨號 | PT0102 |
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供貨周期 | 現貨 |
LabpO TOPO-TA/Blunt通用克隆試劑盒
(不含多克隆酶切位點MCS)
產(chan) 品貨號:PT0102
儲(chu) 存溫度:-20℃儲(chu) 存,至少12個(ge) 月。冰袋運輸,1-2 天置於(yu) 室外常溫不影響質量。
試劑盒組成、儲(chu) 存、穩定性: | ||
試劑盒組成 | 20次 | 80次 |
TOPO-TA/Blunt Simple Vector(30ng/ul) | 40ul | 160ul |
1000bp Control(30ng/ul) | 5ul | 5ul |
10 x Enhancer | 20ul | 80ul |
產(chan) 品介紹:
本製品和傳(chuan) 統的T4連接酶原理不同,它利用了Topoisomerase可以在瞬間(幾sec-幾min)、高效,連接DNA片段的原理采用本公司du創的工藝製成。
(1)可以在瞬間(幾sec-幾min)完成任意PCR產(chan) 物(兼容A末端/平末端)連接。
(2)特製的新型載體(ti) 質粒大小僅(jin) 僅(jin) 不到2kb,充分發揮了TOPO載體(ti) 越小,可容納片段越大的優(you) 勢,最da限度提高了大片段連接效率;連接後質粒大小比傳(chuan) 統載體(ti) 小2kb以上,質粒越小,轉化效率越高,極大的提高了各種片段連接後的轉化子數量。
(3)采用氨苄抗性載體(ti) 隻需10min複蘇時間,比卡那抗性載體(ti) 1小時複蘇時間縮短6倍。
(4)最ku可以不用冰浴和熱休克,室溫5min內(nei) 完成轉化;無需1小時複蘇,隻需37℃10 min複蘇便可以塗板。從(cong) 連接到塗板最kuai隻需15-20min。
(5)自sha基因零背景原理,無自連假陽性,無需繁瑣藍白斑篩選和菌落PCR篩選。大部分情況下隨機挑一個(ge) 克隆便是有插入的。
(6)連接長片段能力遠超傳(chuan) 統TA/Blunt克隆載體(ti) ,可連接長達10kb片段(例如連接5kb片段,也可能達到挑10個(ge) 菌落,至少8個(ge) 是有插入的效果),是新一代世jie領xian的簡單、快速、零背景免篩選的TOPO TA/Blunt克隆載體(ti) 。
本製品在克隆插入位點兩(liang) 側(ce) 不含多克隆酶切位點(Simple),需要時可在 PCR 擴增引物上導入合適的酶切位點。此時如果使用PCR 擴增引物導入的酶切位點進行酶切時, 酶切反應將不會(hui) 受到載體(ti) 上其它多克隆酶切位點影響,可大大提高酶切效率,增加亞(ya) 克隆成功率。
注意:測序隻能采用M13F/M13R通用引物測序(見後麵圖譜),但是不能采用M13(-47)/M13(-48)通用引物測序。菌落PCR可使用和測序相同的引物。
操作步驟:
1.連接反應的準備:
PCR引物使用正常設計的引物即可,不需做任何改變(不能用磷酸化引物)。任意PCR產(chan) 物(兼容A末端/平末端)均可以直接連接。PCR產(chan) 物一般建議膠回收純化,這樣可以避免後續可能的問題。如果PCR產(chan) 物僅(jin) 有目的條帶、無非特異條帶和引物二聚體(ti) ,也可嚐試直接進行連接反應。如果是以質粒為(wei) 模板的PCR產(chan) 物則最hao進行純化,因為(wei) 模板質粒也可能長出菌落(但不是想構建的目的載體(ti) )。
2.連接反應:
1)室溫(25℃-37℃)設立10ul連接體(ti) 係(建議用0.2ml PCR 管,PCR儀(yi) 器控溫):
純化後的PCR產(chan) 物或1ul 1000bp control | 0.5-5ul |
TOPO-TA/Blunt Vector | 2ul |
10 x Enhancer | 1ul |
無菌水 | Xul |
總體(ti) 積 | 10ul |
加完試劑後,用移液器輕輕吹打混勻或者輕彈管底混勻,低速瞬時離心收集所有液體(ti) 在離心管底,注意此步驟不能在冰上進行,隻能在室溫(25℃-37℃)進行。
注:如果使用5ul體(ti) 係連接,各成分按照比例減半使用,使用次數可以加倍。不同大小插入片段的推薦用量(注意過量太多了,反而導致轉化子減少)
插入片段大小(bp) | 推薦用量(ng) |
100-1000 | 10-40 |
1000-2000 | 40-80 |
2000-5000 | 80-180 |
2)室溫(25℃-37℃)連接5min。
本載體(ti) 推薦室溫(25℃-37℃)5min完成連接。長片段或者連接困難片段可以延長連接時間到10-15min,溫度可選37℃,可顯著增加轉化子數量。
3)連接產(chan) 物置於(yu) 冰上備用。立即接標準的感受態轉化步驟或者快速轉化步驟。
3.快速轉化:
1)感受態細胞從(cong) -80℃拿出,迅速插入冰浴中,解凍融化(約1-3min左右)。
2)立刻加入5ul連接液(最多可全部加入,隻要體(ti) 積不超過感受態細胞體(ti) 積的1/10), 用手撥da離心管底輕輕混勻(避免用槍吸打),冰浴放置5min。
3)42℃水浴熱激60秒,迅速放回冰浴靜置2-3min,該過程不要搖動離心管。
注意:此步驟首xuan建議 42℃水浴 60 秒熱激。但是根據經驗,大部分商品化diyi0和DH5a感受態細胞此步驟也可將離心管置於(yu) 室溫(˃22℃)進行, 時間不需十分準確,夏季或室溫較高時,可放置 5-8min左右;如果室溫較低,可延長時間至8-15min左右。有經驗的客戶可以根據具體(ti) 情況嚐試無熱激轉化。
4)加 300-500ul LB或者SOC培養(yang) 基(不含抗生素),37℃ 200 rpm 振蕩培養(yang) 10min。
根據經驗,一般可以直接將培養(yang) 基(如從(cong) 冰箱取出溫度低,應事先置37℃溫箱回溫至22℃-37℃)加入到感受態細胞的1.5 ml 離心管,蓋上離心管蓋,水平固定在振蕩培養(yang) 箱中振蕩培養(yang) 複蘇即可,不需要轉移到試管培養(yang) 複蘇。
一般商品化的感受態細胞不超過 2kb 插入片段情況下,熱休克後 10-15 min複蘇可以得到足夠多轉化子,如果使用實驗室自製的感受態效率低、或者轉化子少、插入片段長的情況下可以提高複蘇時間到 30-60 min以得到更多的轉化子。
5)取100-200ul菌液塗板(培養(yang) 板含氨苄青黴素100ug/ml),培養(yang) 過夜。(如果預計轉化子少,為(wei) 得到較多克隆,4000rpm 離心1min,吸棄掉部分上清,保留100-150ul,輕彈懸浮菌體(ti) ,取全部菌液塗板)。
4.轉化子的篩選鑒定:
本製品采用自sha基因零背景原理,無插入自連的細菌會(hui) 自sha無法生長,因此幾乎沒有假陽性,一般情況下,可以達到所見即所得,隻要是長出來的菌落正常(不是汙染的雜菌,轉化子數量也不算太少),基本就包含插入。因此插入片段不超過 2-3kb 的情況下可以不用菌落PCR 鑒定,直接挑1-2個(ge) 菌去測序。
1)一般本公司TOPO 載體(ti) 陽性率非常高,所以菌落生長正常,數量也不是太少的情況下建議省略菌落PCR/菌液PCR鑒定直接去測序。
注意測序引物不能采用M13(-47)/M13(-48)通用引物測序。
2) TOPO載體(ti) 的菌落 PCR 結果容易出現假陰性。因此在使用菌落 PCR 鑒定的情況下,如菌落PCR結果陽性,一般可以相信此結果。如結果是陰性,或者顯示擴增出大小和預期不符合,一般不可相信,要考慮到菌落 PCR 結果假陰性的可能。需要進一步提取質粒電泳跑大小,或者酶切鑒定來確認。
3) 用上述培養(yang) 的白色菌落的菌液抽提質粒,插入片段較大的情況下,直接跑電泳看質粒大小就直接能鑒定出有插入的質粒,還可用ApaI/BglI/BsaHI,或者插入片段上引入的酶切位點酶切鑒定,瓊脂糖凝膠電泳檢查片段大小,確定是否含有目的片段。
pTOPO-TA/Blunt 載體(ti) 圖譜:
pTOPO-TA/Blunt 載體(ti) 多克隆位點序列: